Perlinganit Ampul ile tedavi edilen hastalarda en sık rastlanan etki baş ağrısıdır, hastaların yaklaşık %2 sinde ortaya çıkar. daha az karşılaşılan yan etkiler şunlardır: Taşikardi, bulantı, kusma, korku, huzursuzluk, kaslarda seyirme, retrosteral rahatsızlık, baş dönmsi, palpitasyon, karın bölgesinde ağrı. Paradoksal taşikardi ve artmış olan bir anginapektoris, Gliserol Trinitrat’ın oluşturduğu hipotansiyona eşlik edebilir.
